WikiEdge:ArXiv-2409.02655v1/methods

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这篇文献的工作部分详细介绍了如何通过实验和理论分析相结合的方法来研究分子马达蛋白UNC-104的运输特性。以下是这部分的主要内容：

1. 实验系统和方法：
   • 使用秀丽隐杆线虫（C. elegans）的PLM神经元作为模型系统，通过RNAi介导的基因敲减来研究泛素样修饰对UNC-104马达蛋白功能的影响。
   • 利用荧光显微镜评估轴突上货物结合UNC-104马达蛋白的分布，并使用FRAP实验探测其动态。
2. 货物结合模型和数据崩溃：
   • 通过主方程模拟货物结合动力学，并使用Fokker-Planck方法模拟马达蛋白密度动态。
   • 通过实验数据和理论分析，揭示了泛素样修饰增强了UNC-104与其货物的合作性结合，但并未影响其运输特性。
3. 理论模型：
   • 构建理论模型来分析轴突上UNC-104密度分布的稳态，并使用实验数据评估运输特性。
   • 通过模型分析，确定了UNC-104的有效扩散性和漂移速度。
4. 数据分析：
   • 通过FRAP实验和理论模型的结合，分析了实验结果，确定了UNC-104在轴突上的稳态分布和动态特性。
   • 研究结果表明，尽管泛素样修饰显著影响了UNC-104的货物结合，但并未改变其运输动态，保持了UNC-104的稳态分布不变。