WikiEdge:ArXiv-2409.02655v1/methods

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這篇文獻的工作部分詳細介紹了如何通過實驗和理論分析相結合的方法來研究分子馬達蛋白UNC-104的運輸特性。以下是這部分的主要內容：

1. 實驗系統和方法：
   • 使用秀麗隱杆線蟲（C. elegans）的PLM神經元作為模型系統，通過RNAi介導的基因敲減來研究泛素樣修飾對UNC-104馬達蛋白功能的影響。
   • 利用熒光顯微鏡評估軸突上貨物結合UNC-104馬達蛋白的分佈，並使用FRAP實驗探測其動態。
2. 貨物結合模型和數據崩潰：
   • 通過主方程模擬貨物結合動力學，並使用Fokker-Planck方法模擬馬達蛋白密度動態。
   • 通過實驗數據和理論分析，揭示了泛素樣修飾增強了UNC-104與其貨物的合作性結合，但並未影響其運輸特性。
3. 理論模型：
   • 構建理論模型來分析軸突上UNC-104密度分佈的穩態，並使用實驗數據評估運輸特性。
   • 通過模型分析，確定了UNC-104的有效擴散性和漂移速度。
4. 數據分析：
   • 通過FRAP實驗和理論模型的結合，分析了實驗結果，確定了UNC-104在軸突上的穩態分佈和動態特性。
   • 研究結果表明，儘管泛素樣修飾顯著影響了UNC-104的貨物結合，但並未改變其運輸動態，保持了UNC-104的穩態分佈不變。