作者面對的是細胞內貨物運輸機制中，特別是分子馬達運輸特性與貨物結合之間複雜關係的理解不足問題。具體問題包括：
- 分子馬達運輸特性與貨物結合之間的關係：儘管分子馬達在細胞內貨物運輸中扮演着關鍵角色，但馬達運輸特性與貨物結合如何影響馬達分布的確切關係仍然不充分理解。
- 泛素化等翻譯後修飾對分子馬達功能的影響：泛素化及其類似修飾在調控分子馬達的數量、活性和貨物結合中起着關鍵作用，其異常調控與多種神經退行性疾病相關。
- 分子馬達與貨物的協同結合機制：研究中發現泛素化修飾可以改變Kinesin-3馬達UNC-104/KIF1A的貨物結合，進而影響其運輸特性和分布，但這種協同結合機制尚不明確。